在水环境整治方面，我市将加大流域内企业废污水排放治理力度和污水处理厂建设力度。到2016年，主城区污水管网覆盖率达到90%，主城区城市污水集中处理率提高到95%。在农村连片整治示范区内，生活污水处理率不低于60%，畜禽粪便综合利用率不低于70%，村民饮用水卫生合格率不低于90%，生活垃圾定点存放清运率达100%，生活垃圾无害化处理率不低于70%。
在水生态保护与修复方面，初步建立有效的水土流失综合防治体系，构建河湖水生态保护体系。试点期内，每年在巢湖增殖放流鲢鱼、鳙鱼等鱼苗1100万尾、大银鱼卵3亿粒以上，年均河道生态补给水量2000万立方米。同时，在环巢湖周边完成人工造林30万亩。
在水资源配置方面，统筹城乡供水，加快建设区域性调水工程。到2016年，城市供水能力达到220万立方米/天，实现全市农村人口饮水安全全覆盖。试点期间，实施龙河口水库引水工程，完善驷马山引江工程，建设工业水厂，扩大分质供水。
此外，我市将挖掘与保护三国故里、包拯家乡、巢湖水下古城遗址、三河古镇等地区历史文化。在水生态文明城市建设中，增加文化元素、人文景观和民族民风要素。
